Project: BioMAV
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package nl.ru.ai.projects.parrot.ea.evolve; 
 
import java.util.ArrayList; 
 
import nl.ru.ai.projects.parrot.tools.TerminalCondition; 
 
import org.jgap.Configuration; 
import org.jgap.DefaultFitnessEvaluator; 
import org.jgap.InvalidConfigurationException; 
import org.jgap.event.EventManager; 
import org.jgap.impl.BestChromosomesSelector; 
import org.jgap.impl.ChromosomePool; 
import org.jgap.impl.GABreeder; 
import org.jgap.impl.StockRandomGenerator; 
import org.jgap.util.ICloneable; 
 
public class EAConfiguration extends Configuration implements ICloneable { 
 
 private static final long serialVersionUID = 1L; 
  
 private ArrayList<TerminalCondition> stopConditions; 
  
 public final int MAX_EVOLUTIONS = 30;  //150  // Maximum number of evolutions 
 public final int POPULATION_SIZE = 25; //50 
 public final boolean ELITISM = true; 
  
 public final int FSM_TIMER_THRESHOLD = 300000;//600000;  // The time in ms the FSM will run for each individual on each evolutionary cycle 
  
 public final boolean OUTPUT_FITNESS_HISTORY = true;  // True when fitness of best performing individual at each step in evolutionary cycle should be displayed 
 public final boolean OUTPUT_FITNESS_END = true;   // True when fitness of best performing individual at end of evolutionary cycle should be displayed 
 public final int OUTPUT_TIMINGS_ATITERATION = 10;   // Indicates at what iteration-interval the timings of the best performing individual at that point should be displayed (0=no displaying at all) 
  
 public EAConfiguration() { 
  super(); 
  try { 
   setBreeder(new GABreeder()); 
   setRandomGenerator(new StockRandomGenerator()); 
   setEventManager(new EventManager()); 
   BestChromosomesSelector bestChromsSelector = new BestChromosomesSelector(this, 0.70d); 
   bestChromsSelector.setDoubletteChromosomesAllowed(false); 
   addNaturalSelector(bestChromsSelector, false); 
   setMinimumPopSizePercent(80); 
   setSelectFromPrevGen(0.8d); 
   setKeepPopulationSizeConstant(true); 
   setFitnessEvaluator(new DefaultFitnessEvaluator()); 
   setAlwaysCaculateFitness(false); 
   setChromosomePool(new ChromosomePool()); 
    
   setPreservFittestIndividual(ELITISM); 
    
   stopConditions = new ArrayList<TerminalCondition>(); 
  } catch ( InvalidConfigurationException e ) { 
   throw new RuntimeException("Fatal error: could not load configuration for the evoluationary algorithm"); 
  } 
 } 
  
 /**
  * Returns all stop conditions 
  * @return A list of stop conditions 
  */ 
 public ArrayList<TerminalCondition> getStopConditions() { 
  return stopConditions; 
 } 
  
 /**
  * Adds a stop condition to the list of stop conditions 
  * @param condition The stop condition to add 
  */ 
 public void setStopCondition(TerminalCondition condition) { 
  stopConditions.add(condition); 
 } 
}